Jezioro Zagłębocze ma powierzchnię 59 ha. Pod względem powierzchni zajmuje 14 miejsce wśród jezior Lubelszczyzny.

Należy do jezior głębokich (23,3 m), w których w okresie letnim występuje charakterystyczne uwarstwienie termiczne. Występują tu trzy warstwy wody znacznie różniące się temperaturą.

Górna, powierzchniowa warstwa to wody nagrzane, ciepłe.

Pod nią, na głębokości 3 - 5 m, znajduje się warstwa skoku termicznego (tzw. termoklina), gdzie następuje gwałtowny spadek temperatury. Warstwa ta oddziela górną  nagrzaną warstwę wody od dolnej, zimnej, o stałej temperaturze. Wody tych warstw nie mieszają się ze sobą przez całe lato.

W  okresie jesieni gdy woda oziębia się, dochodzi stopniowo do wyrównania temperatury. Następuje wymieszanie warstw wody (tzw. jesienna cyrkulacja) i następuje przejście do uwarstwienia odwrotnego w zimie, gdzie najcieplejsze wody o temp. ok. 4^o C występują przy dnie, a najzimniejsze, o temp. ok. 0^o C na powierzchni.

Wiosna jest znowu okresem cyrkulacji. Cykl ten powtarza się co roku.

Wody jeziora Zagłębocze są dobrej jakości, charakteryzują się znaczną przeźroczystością.

W płytszych rejonach jeziora bujnie rozwija się roślinność. Występują między innymi będące pod ochroną gatunkową grzybienie północne („lilie wodne”).

W jeziorze występują 23 gatunki ryb, m.in. rzadkie i cenne ryby z rodziny łososiowatych - sieja i sielawa, a ponadto: szczupak, sum, lin, leszcz, krąp, płoć, wzdręga, okoń, karaś pospolity, karaś srebrzysty, węgorz, kiełb, ukleja, sumik karłowaty, słonecznica, jazgarz, jaź, objęte ochroną różanka i piskorz,  oraz raki błotne.

Jezioro Zagłębocze jest łowiskiem licencyjnym, wędkowanie możliwe po wykupieniu zezwolenia. Rodzaje zezwoleń, cennik oraz punkty dystrybucji pod linkiem: https://zaglebocze.pzw.pl/strefa-wedkarza/cennik-zezwolen-na-sportowy-polow-ryb-w-jez-zaglebocze-w-2025-r